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データの取得とデータベースへの格納

Ryotas edited this page Jun 22, 2017 · 2 revisions

Summary と Projects の二つのディレクトリがあるが、Projects(それぞれのプロジェクト)のデータを使っている。その理由は以下の二つ。

  • TSV ファイルが欲しいが、Summary には SSM が VCF(simple_somatic_mutation.aggregated.vcf.gz)でのみ含まれている
  • テストの際には、小さくて整合性の取れたデータセットが必要
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