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jinseob2kim committed Nov 16, 2024
1 parent 5fb6a2a commit 3984fcb
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Showing 4 changed files with 116 additions and 7 deletions.
67 changes: 64 additions & 3 deletions docs/japanR2024/index.html
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -423,7 +423,7 @@ <h2>自己紹介</h2>
</ul>
<p><strong>[email protected], github.com/jinseob2kim</strong></p>
<aside class="notes">
<p>こんにちは。私(わたくし)はキム・ジンソプと申(もう)します。本日(ほんじつ)は韓国(かんこく)の医学研究(いがくけんきゅう)分析(ぶんせき)を紹介(しょうかい)させていただきます</p>
<p>こんにちは。私(わたくし)はキム・ジンソプと申(もう)します。本日(ほんじつ)は韓国(かんこく)の医学研究(いがくけんきゅうのためのオープンソースR統計(とうけい)パッケージ</p>
<p>時間(じかん)が限(かぎ)られているため、簡潔(かんけつ)に自己(じこ)紹介(しょうかい)と私(わたくし)が開発(かいはつ)したRパッケージ、そして韓国(かんこく)のRコミュニティ「シャイニーコリア」についてお話(はなし)しします。今後(こんご)も皆(みな)さんとの交流(こうりゅう)を持続的(じぞくてき)に行(おこな)いたいと思(おも)っており、次回(じかい)のミートアップでは必(かなら)ず日本(にほん)を訪(おとず)れ、参加(さんか)したいと考(かんが)えています。</p>
<p>私(わたくし)は韓国(かんこく)で「ツァラトゥ」という医学研究(いがくけんきゅう)支援(しえん)会社(かいしゃ)を創業(そうぎょう)し、6年間(ろくねんかん)運営(うんえい)しております。この会社(かいしゃ)は、研究者(けんきゅうしゃ)と製薬(せいやく)会社(かいしゃ)に分析(ぶんせき)サービスを提供(ていきょう)しています。私たちの分析(ぶんせき)機能(きのう)はRパッケージとしてCRANに公開(こうかい)されており、継続的(けいぞくてき)に更新(こうしん)しています。日本(にほん)のユーザーのブログでも度々(たびたび)紹介(しょうかい)されています。</p>
<p>私(わたくし)は韓国(かんこく)の医科大学(いかだいがく)を卒業(そつぎょう)後(ご)、保健(ほけん)大学院(だいがくいん)で予防医学(よぼういがく)を専攻(せんこう)し、その後(そのご)サムスン電子(でんし)の無線(むせん)事業部(じぎょうぶ)ヘルスサービスグループで勤務(きんむ)しました。</p>
Expand All @@ -450,6 +450,21 @@ <h2>医学研究のためのスR統計パッケージ</h2>
<center>
<a href="https://github.com/jinseob2kim/"><img src="Unknown-2.png" width="50%"></a>
</center>
<aside class="notes">
<p>今回ご紹介するRパッケージは3つで、CRANから合計17万回ダウンロードされました。 콘카이 고쇼오카이스루 아아루팟케에지와 밋츠데, 크란 카라 고오케에 주우나나만카이 다운로오도사레마시타</p>
<p>第一に、生存分析のKaplan-meier絵を描くjskm、第二に、多様な回帰分析結果を論文用テーブルに作るjstable、最後に各分析機能をShiny moduleにして、これを集めてローカルで実行可能な分析ウェブを提供するjsmoduleです。 다이이치니, 세에존분세키노 카푸란마이아아에오 에가쿠 jskm, 다이 니니 타요오나 카이키분세키켓카오 론분요오테에부루니 츠쿠루 jstable, 사이고니 카쿠분세키키노오오 샤이니이 모주우루니 시테 코레오 아츠메테 로오카루데 짓코오 카노오나 분세키웨부오 테에쿄오스루 jsmodule 데스</p>
<p>以下のスクリーンショットは、3 パッケージのクランの累積ダウンロード数です。 이카노 스쿠리이쇼쯔토와 산 팟케에지노 쿠란노 루이세키다운로오도스우데스</p>
<style type="text/css">
span.MJX_Assistive_MathML {
position:absolute!important;
clip: rect(1px, 1px, 1px, 1px);
padding: 1px 0 0 0!important;
border: 0!important;
height: 1px!important;
width: 1px!important;
overflow: hidden!important;
display:block!important;
}</style></aside>
</section>
<section id="section" class="slide level2">
<h2></h2>
Expand All @@ -462,6 +477,19 @@ <h2></h2>
</div><div class="column" style="width:50%;">
<p><img data-src="https://github.com/jinseob2kim/jskm/raw/master/man/figures/README-unnamed-chunk-3-1.png"></p>
</div></div>
<aside class="notes">
<p>まず、JSKMをご紹介します。 このパッケージは医学研究で多く利用されるKapan-meierの絵のために作られ、Landmark分析、Competing risk分析、そしてアメリカ国民健康栄養調査のようなSurvey dataを支援することが最大の特徴です。 마즈 제에에스케에에무오 고쇼오카이시마스 코노 팟케에지와 이가쿠켄큐우데 오오쿠 리요오사레루 카판마이아아노 에노 타메니 츠쿠라레 란도마아쿠분세키 콘피티구 리스쿠분세키 소시테 아메리카 코쿠민켄코오에에요오초오사노요오나 사아베이 데에타오 시엔스루 코토가 사이다이노 토쿠초오데스</p>
<style type="text/css">
span.MJX_Assistive_MathML {
position:absolute!important;
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padding: 1px 0 0 0!important;
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}</style></aside>
</section>
<section id="日本ブログレビュー" class="slide level2">
<h2>日本ブログレビュー</h2>
Expand All @@ -471,13 +499,29 @@ <h2>日本ブログレビュー</h2>
</div><div class="column" style="width:50%;">
<p><img data-src="jskm_japan2.png"></p>
</div></div>
<p>Landmark, Competing risk analysis support</p>
<p>Survey data, Landmark, Competing risk analysis support</p>
<aside class="notes">
<p>特に日本の研究者の方がランドマーク分析機能をたくさん利用してくださって、ブログレビューがたくさんあります。 토쿠니 니혼노 켄큐우샤노 호오가 란도마아쿠분세키키노오오 타쿠산 리요오시테쿠다삿테 부로구레뷰우가 타쿠산 아리마스</p>
<style type="text/css">
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</section>
<section id="section-1" class="slide level2">
<h2></h2>
<center>
<a href="https://github.com/jinseob2kim/jstable"><img src="jstable.png" width="100%"></a>
</center>
<ul>
<li>GLM, Cox, Linear mixed model, GEE, Survey glm, survey cox</li>
</ul>
<div class="columns">
<div class="column" style="width:50%;">
<div class="sourceCode" id="cb1"><pre class="sourceCode numberSource r number-lines code-with-copy"><code class="sourceCode r"><span id="cb1-1"><a href=""></a><span class="do">## Gaussian</span></span>
Expand Down Expand Up @@ -508,6 +552,19 @@ <h2></h2>
<span id="cb4-9"><a href=""></a><span class="sc">$</span>last.lines</span>
<span id="cb4-10"><a href=""></a>[<span class="dv">1</span>] <span class="st">"No. of observations = 32</span><span class="sc">\n</span><span class="st">AIC value = 23.8304</span><span class="sc">\n\n</span><span class="st">"</span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div></div>
<aside class="notes">
<p>特に日本の研究者の方がランドマーク分析機能をたくさん利用してくださって、ブログレビューがたくさんあります。 토쿠니 니혼노 켄큐우샤노 호오가 란도마아쿠분세키키노오오 타쿠산 리요오시테쿠다삿테 부로구레뷰우가 타쿠산 아리마스</p>
<style type="text/css">
span.MJX_Assistive_MathML {
position:absolute!important;
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padding: 1px 0 0 0!important;
border: 0!important;
height: 1px!important;
width: 1px!important;
overflow: hidden!important;
display:block!important;
}</style></aside>
</section>
<section id="subgroup-analysis" class="slide level2">
<h2>Subgroup analysis</h2>
Expand Down Expand Up @@ -560,7 +617,11 @@ <h2></h2>
<img data-src="그림1.png" class="r-stretch"></section>
<section id="論文支援実績" class="slide level2">
<h2>論文支援実績</h2>
<p>SCI論文200編以上支援 - 医学分野 トップジャーナル NEJM、LANCET、JAMAを含む</p>
<p>SCI論文200編以上支援</p>
<ul>
<li>医学分野 トップジャーナル NEJM、LANCET、JAMAを含む</li>
<li>6つの大学病院と年単位研究支援契約、10のバイオ会社の臨床試験分析支援</li>
</ul>

<img data-src="그림2.png" class="r-stretch"></section>
<section id="無料統計ウェブ" class="slide level2">
Expand Down
48 changes: 45 additions & 3 deletions docs/japanR2024/index.qmd
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -36,9 +36,9 @@ subtitle: "Zarathu Co., Ltd"
**jinseob2kim\@gmail.com, github.com/jinseob2kim**

::: notes
こんにちは。私(わたくし)はキム・ジンソプと申(もう)します。本日(ほんじつ)は韓国(かんこく)の医学研究(いがくけんきゅう)分析(ぶんせき)を紹介(しょうかい)させていただきます
こんにちは。私(わたくし)はキム・ジンソプと申(もう)します。本日(ほんじつ)は韓国(かんこく)の医学研究(いがくけんきゅうのためのオープンソースR統計(とうけい)パッケージ

時間(じかん)が限(かぎ)られているため、簡潔(かんけつ)に自己(じこ)紹介(しょうかい)と私(わたくし)が開発(かいはつ)したRパッケージ、そして韓国(かんこく)のRコミュニティ「シャイニーコリア」についてお話(はなし)しします。今後(こんご)も皆(みな)さんとの交流(こうりゅう)を持続的(じぞくてき)に行(おこな)いたいと思(おも)っており、次回(じかい)のミートアップでは必(かなら)ず日本(にほん)を訪(おとず)れ、参加(さんか)したいと考(かんが)えています
本発表では私が開発した医学研究用Rパッケージを紹介し、創業した会社でこれをどのように利用するのか、オープンソースパッケージの管理はどのようにするのか簡単に紹介します。 今後、日本のRユーザーの方々、医学研究者の方々と交流したいです

私(わたくし)は韓国(かんこく)で「ツァラトゥ」という医学研究(いがくけんきゅう)支援(しえん)会社(かいしゃ)を創業(そうぎょう)し、6年間(ろくねんかん)運営(うんえい)しております。この会社(かいしゃ)は、研究者(けんきゅうしゃ)と製薬(せいやく)会社(かいしゃ)に分析(ぶんせき)サービスを提供(ていきょう)しています。私たちの分析(ぶんせき)機能(きのう)はRパッケージとしてCRANに公開(こうかい)されており、継続的(けいぞくてき)に更新(こうしん)しています。日本(にほん)のユーザーのブログでも度々(たびたび)紹介(しょうかい)されています。

Expand All @@ -56,6 +56,20 @@ CRAN(計17万回ダウンロード)

<center><a href="https://github.com/jinseob2kim/"><img src="Unknown-2.png" width="50%"/></a></center>


::: notes
今回ご紹介するRパッケージは3つで、CRANから合計17万回ダウンロードされました。
콘카이 고쇼오카이스루 아아루팟케에지와 밋츠데, 크란 카라 고오케에 주우나나만카이 다운로오도사레마시타

第一に、生存分析のKaplan-meier絵を描くjskm、第二に、多様な回帰分析結果を論文用テーブルに作るjstable、最後に各分析機能をShiny moduleにして、これを集めてローカルで実行可能な分析ウェブを提供するjsmoduleです。
다이이치니, 세에존분세키노 카푸란마이아아에오 에가쿠 jskm, 다이 니니 타요오나 카이키분세키켓카오 론분요오테에부루니 츠쿠루 jstable, 사이고니 카쿠분세키키노오오 샤이니이 모주우루니 시테 코레오 아츠메테 로오카루데 짓코오 카노오나 분세키웨부오 테에쿄오스루 jsmodule 데스

以下のスクリーンショットは、3 パッケージのクランの累積ダウンロード数です。
이카노 스쿠리이쇼쯔토와 산 팟케에지노 쿠란노 루이세키다운로오도스우데스
:::



##

<center><a href="https://github.com/jinseob2kim/jskm"><img src="jskm.png" width="100%"/></a></center>
Expand All @@ -70,6 +84,13 @@ CRAN(計17万回ダウンロード)
:::
:::


::: notes
まず、JSKMをご紹介します。 このパッケージは医学研究で多く利用されるKapan-meierの絵のために作られ、Landmark分析、Competing risk分析、そしてアメリカ国民健康栄養調査のようなSurvey dataを支援することが最大の特徴です。
마즈 제에에스케에에무오 고쇼오카이시마스 코노 팟케에지와 이가쿠켄큐우데 오오쿠 리요오사레루 카판마이아아노 에노 타메니 츠쿠라레 란도마아쿠분세키 콘피티구 리스쿠분세키 소시테 아메리카 코쿠민켄코오에에요오초오사노요오나 사아베이 데에타오 시엔스루 코토가 사이다이노 토쿠초오데스
:::


## 日本ブログレビュー

::: columns
Expand All @@ -82,9 +103,15 @@ CRAN(計17万回ダウンロード)
:::
:::

Landmark, Competing risk analysis support
Survey data, Landmark, Competing risk analysis support



::: notes
特に日本の研究者の方がランドマーク分析機能をたくさん利用してくださって、ブログレビューがたくさんあります。
토쿠니 니혼노 켄큐우샤노 호오가 란도마아쿠분세키키노오오 타쿠산 리요오시테쿠다삿테 부로구레뷰우가 타쿠산 아리마스
:::

##

<center><a href="https://github.com/jinseob2kim/jstable"><img src="jstable.png" width="100%"/></a></center>
Expand Down Expand Up @@ -134,6 +161,13 @@ $last.lines
:::



::: notes
次はjstableです。 このパッケージは回帰分析結果を論文用テーブルにしてくれるパッケージで、単変量分析、univariate analysis結果を一緒に見せてくれるのが特徴です。 回帰分析、GLM、Cox、Linearmixed model、GEE、Survey glm、survey coxなど様々な回帰モデルをサポートします。 下のコードにあるように、glmshow.displayはGLM結果を示す関数です。
츠기와 제에에스티이에에비이에루이이데스 코노 팟케에지와 카이키분세키켓카오 론분요오테에부루니 시테쿠레루 팟케에지데 탄헨료오분세키 유우니붸리이아토 아나리시스켓카오 잇쇼니 미세테쿠레루노가 토쿠초오데스 카이키분세키 지이에루에무 시이옷쿠스 리니이아아밋쿠스토 모데루 지이 사아베이 지이에루에무 사아베이 콧쿠스나도 사마자마나 카이키모데루오 사포오토시마스 시타노 코오도니 아루요오니 지이에루에무에스에에치오오다부류우 디스푸레에와 지이에루에무켓카오 시메스 칸스우데스

:::

## Subgroup analysis

```r
Expand Down Expand Up @@ -169,6 +203,12 @@ sex Overall 228 100 1.91 1.14 3.2 100 100 0.014

```

::: notes
次はjstableです。 このパッケージは回帰分析結果を論文用テーブルにしてくれるパッケージで、単変量分析、univariate analysis結果を一緒に見せてくれるのが特徴です。 回帰分析、GLM、Cox、Linearmixed model、GEE、Survey glm、survey coxなど様々な回帰モデルをサポートします。 下のコードにあるように、glmshow.displayはGLM結果を示す関数です。
츠기와 제에에스티이에에비이에루이이데스 코노 팟케에지와 카이키분세키켓카오 론분요오테에부루니 시테쿠레루 팟케에지데 탄헨료오분세키 유우니붸리이아토 아나리시스켓카오 잇쇼니 미세테쿠레루노가 토쿠초오데스 카이키분세키 지이에루에무 시이옷쿠스 리니이아아밋쿠스토 모데루 지이 사아베이 지이에루에무 사아베이 콧쿠스나도 사마자마나 카이키모데루오 사포오토시마스 시타노 코오도니 아루요오니 지이에루에무에스에에치오오다부류우 디스푸레에와 지이에루에무켓카오 시메스 칸스우데스

:::


## 中国での映像やブログレビュー

Expand Down Expand Up @@ -206,7 +246,9 @@ sex Overall 228 100 1.91 1.14 3.2 100 100 0.014
## 論文支援実績

SCI論文200編以上支援

- 医学分野 トップジャーナル NEJM、LANCET、JAMAを含む
- 6つの大学病院と年単位研究支援契約、10のバイオ会社の臨床試験分析支援

![](그림2.png)

Expand Down
6 changes: 5 additions & 1 deletion docs/osfestival/index.html
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -544,7 +544,11 @@ <h2></h2>
<img data-src="jsmodule3.png" class="r-stretch"></section>
<section id="논문지원-실적" class="slide level2">
<h2>논문지원 실적</h2>
<p>SCI 논문 200편이상 지원 - 의학분야 탑저널 NEJM, LANCET, JAMA 포함</p>
<p>SCI 논문 200편이상 지원</p>
<ul>
<li>의학분야 탑저널 NEJM, LANCET, JAMA 포함</li>
<li>6개 대학병원과 연단위 연구지원 계약, 10개 바이오회사의 임상시험분석 지원원</li>
</ul>

<img data-src="그림2.png" class="r-stretch"></section>
<section id="무료-통계웹" class="slide level2">
Expand Down
2 changes: 2 additions & 0 deletions docs/osfestival/index.qmd
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -220,7 +220,9 @@ sex Overall 228 100 1.91 1.14 3.2 100 100 0.014
## 논문지원 실적

SCI 논문 200편이상 지원

- 의학분야 탑저널 NEJM, LANCET, JAMA 포함
- 6개 대학병원과 연단위 연구지원 계약, 10개 바이오회사의 임상시험분석 지원

![](그림2.png)

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