Dates 16-18 décembre 2024.
Lieu Bat B2M, Gustave Roussy
Responsables Pr. Daniel GAUTHERET (Univ. Paris-Saclay, I2BC), MD. PhD. Julien VIBERT (Gustave Roussy), PhD. Yoann Pradat
Intervenants PhD. Elsa BERNARD (Gustave Roussy), PhD. Yoann PRADAT (Gustave Roussy), MD. PhD. Roger SUN
Un niveau licence est requis pour bien comprendre les notions méthodologiques qui seront abordées. Une initiation au langage de programmation R est nécessaire et l'usage d'un ordinateur personnel est indispensable.
Les étudiants ne maîtrisant pas R doivent suivre obligatoirement avant la séance les 3 cours de Gaelle Lelandais présentés dans ces vidéos:
Pour tester votre niveau et pour vous initier à travailler avec des fichiers R markdown (.Rmd), vous êtes invités
à faire les exercices du TP Rbeginner disponible dans le chemin TPs > R_beginner > Rbeginner-exercices-1-3.Rmd. La
correction vous est fournie dans le fichier Rbeginner-exercices-1-3.corr.Rmd.
Les données de séquençage nouvelle génération (next-generation sequencing - NGS - en anglais) révolutionnent les pratiques de recherche médicale et de soin, en produisant des portraits moléculaires d'une précision inégalée. Dans cette UE, nous décrirons quelques unes des données produites par les technologies NGS et comment ces données peuvent être utilisées pour décrire précisément le profil de la tumeur d'un individu et guider la prise en charge médicale. Vous apprendrez les bases d'une poignée de méthodes d'apprentissage automatique (machine learning) et verrez des applications de ces méthodes sur des données publiques.
Le programme de cette UE est maintenu à jour sur la feuille Google suivante https://docs.google.com/spreadsheets/d/14fmvp__8kX0CrDN6MYRVjJE06OX_VHfkbXtPkB7qAhA/edit?gid=0#gid=0