R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu.
Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další. Cílem je naučit studenty analýzu molekulárních dat v programovacím jazyce R, představit dostupné balíčky pro analýzu molekulárních dat. Praktické vyzkoušení analýzy vlastních nebo poskytnutých dat.
Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Nutná je alespoň minimální znalost molekulární biologie a vhodná je předchozí znalost alespoň některých metod analýz DNA dat.
Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.
Kurz poběží turnusově 5 dnů, přičemž 4 dny poběží výuka a poslední den bude na zápočty a individuální konzultace. Tento poslední den účastníci mohou (což je vřele doporučeno), ale nemusí využít.
- Informace o kurzu: https://trapa.cz/cs/kurz-molekularni-data-r-2024
- Kurz ve studijním informačním systému: https://is.cuni.cz/studium/predmety/index.php?do=predmet&kod=MB120C16
- Materiály z kurzu: https://soubory.trapa.cz/rcourse/
- Kontakt na autora: https://trapa.cz/cs/contakt
Viz LICENSE.md a https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.cs
R is nowadays probably the most powerful tool for calculations of all kinds. There are plenty of modules available for work with molecular data. Those will be introduced during the course.
The course contains theory of used methods, tutorials with test data, tasks for individual work of participants, and more. The aim is to teach students how to analyze molecular data in R programming language, introduce available packages for analysis of molecular data. Practical work with own or provided data.
Previous knowledge of R is useful, but not necessary. At least basic knowledge of molecular biology is required, previous knowledge about any methods how to analyze DNA data is recommended.
The course will be taught 5 days, while 4 days are for teaching and last day is for exams and individual consultations. Course participants can stay this last day (which is recommended), but it is not conditional.
If there is at least one participant not speaking Czech, the course will be in English.
- Information about the course: https://trapa.cz/en/course-molecular-data-r-2024
- Course in Study Information System: https://is.cuni.cz/studium/eng/predmety/index.php?do=predmet&kod=MB120C16
- Course materials: https://soubory.trapa.cz/rcourse/
- Contact author: https://trapa.cz/en/contact
See LICENSE.md and https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.en