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Una lista de recursos para Bioinformática con contenido en español y en inglés.

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ToyokoLabs/Recursos-de-Bioinformatica

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Recursos de Bioinformática 🧬 💻

Una lista de recursos para Bioinformática con contenido en español y en inglés.

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Temas

Cursos

Principiantes

Biology Meets Programming: Bioinformatics for Beginners En inglés, subtitulos en español.

Whole genome sequencing of bacterial genomes - tools and applications En inglés, subtitulos en español.

Bioinformatics: Introduction and Methods Introducción a la bioinformática y sus métodos. En inglés, subtitulos en español.

Python for Genomic Data Science Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Intermedio

Bioinformatics Specialization Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Command Line Tools for Genomic Data Science Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Bacterial Bioinformatics En inglés, subtitulos en español.

Avanzado

Bioconductor for Genomic Data Science Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Algorithms for DNA Sequencing Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Genomic Data Science Specialization Herramientas y técnicas para trabajar con datos de secuenciación. En inglés, subtitulos en español.

Plant Bioinformatics En inglés, subtitulos en español.

Plant Bioinformatic Methods Specialization Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Otros cursos

Laboratorio de datos Una introducción a los aspectos prácticos de la Ciencia de Datos.

Data Science: Foundations using R Specialization Tiene una prueba gratis (free trail) por 7 días. En inglés, subtitulos en español.

Julia Scientific Programming En inglés, subtitulos en español.

Algunos videos

Introducción a la bioinformática: ¿por qué es importante? Intro muy básica.

Diseño de primers y análisis de secuenciamiento de genes

Ciclo de Seminarios de la A2B2C

La Bioinformática en países hispanohablantes

Bioinformática y sus aplicaciones a la ciencia

Libros

Python para Bioinformática Una sólida introducción a la programación con Python, muy accesible para los lectores sin experiencia previa en programación. Python for Bioinformatics está pensado para biólogos, bioinformáticos y otros profesionales de las ciencias de la vida.

Vida.exe, desafíos y aventuras de la bioinformática En Vida.exe, un grupo de jóvenes científicas y científicos cuentan cómo la revolución tecnológica impactó en la biología, explican el pasado de ese extraño centauro que es la bioinformática y lo usan de excusa para dar cuenta de cómo se trabaja actualmente desde la ciencia para intentar descifrar los enigmas de la vida.

Herramientas

Gestores de paquetes y librerias

Bioconductor Sofware para el análisis de la información genómica de high-throughput Web

Bioconda Bioconda es un canal para el manejador de paquetes Conda especializado en software bioinformático. Web

Biopython Herramientas de Python para bioinformática. Web

BioJulia La infraestructura bioinformática para el lenguaje de programación Julia. Web

Rust-Bio This library provides Rust implementations of algorithms and data structures useful for bioinformatics.

SeqAn3 Template library para el análisis de las secuencias biológicas.

(Poly)merasa Poly es un paquete de Go para organismos ingenierizados.

Herramientas para Next Generation Sequencing

Procesamiento de secuencias

AfterQC Filtrado automático, trimming, remover errores y control de calidad para fastq data.

FastQC Control de calidad para high throughput sequence data.

MultiQC Los resultados de los análisis bioinformáticos de muchas muestras en un solo reporte.

MaSuRCA (Maryland Super Read Cabog Assembler) Genome assembler. Desde la versión 3.2.1 es compatible con el ensamblaje híbrido de lecturas cortas de Illumina y long high error PacBio/MinION data.

Herramientas para proteinas

ColabFold ColabFold hace que la predicción de la estructura de las proteínas sea accesible, permitiendo incorporar las características novedosas, y todo el potencial, de AlphaFold2 y RoseTTAFold.

Bioinformática en Argentina

Computational Biology in Argentina Publicación realizada en Plos Computational Biology Journal sobre la situación de la Bioinformática y la Biología computacional en la Argentina.

Biología computacional en Argentina (Versión traducida del paper original Computational Biology in Argentina)

Donde estudiar?

Grupos de investigación

Bioinformática Estructural Cristina Marino Buslje - Fundación Instituto Leloir.

SBG Structural Bioinformatics Group Gustavo Parisi - Universidad Nacional de Quilmes.

Laboratorio de Estructura Plasticidad y Función de Proteínas Lucia Chemes - IIB Instituto de Investigaciones Biotecnológicas

Laboratorio de Genómica y Bioinformática Fernán Agüero - IIB Instituto de Investigaciones Biotecnológicas

Immunological bioinformatics – Prediction of host pathogen interactions Morten Nielsen - IIB Instituto de Investigaciones Biotecnológicas

Grupo de Investigación en Bioinformática y Quimioinformática (BioChemTICs) Ignacio Ponzoni - Universidad Nacional del Sur

Bioinformatics & Machine Learning Georgina Stegmayer - sinc(i) - Instituto de Investigación en Señales, Sistemas e Inteligencia Computacional

BIOINFORMÁTICA Y AGROINFORMÁTICA Elizabeth Tapia - CIFASIS - Centro Franco Argentino de Ciencias de la Información y de Sistemas

Asociaciones

Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional

RSG-Argentina Grupo de Estudiantes de Bioinformática y Biología Computacional de Argentina

Bioinformática en Bolivia

Grupos de investigación

Centro Nacional de Computación avanzada en Bioinformática y Genómica ((CnCaBo)) Facultad de Cs. Puras y Naturales (FCPN) y el Departamento de Tecnologías de Información y Comunicación (DTIC) de la Universidad Mayor de San Andrés.

Asociaciones

Bioinformática en Chile

Grupos de investigación

Asociaciones

Sociedad Chilena de Bioinformática

Agrupación Chilena de Bioinformática - RSG Chile

Bioinformática en Colombia

Computational Biology in Colombia Publicación realizada en Plos Computational Biology Journal sobre la situación de la Bioinformática y la Biología computacional en Colombia.

Grupos de investigación

Asociaciones

Grupo de estudiantes en Bioinformática y Biología Computacional de Colombia

Sociedad Colombiana de Bioinformatica y Biología Computacional (SC2B2)

Bioinformática en Ecuador

Grupos de investigación

Asociaciones

Regional Student Group Ecuador (RSG Ecuador)

Sociedad Ecuatoriana De Biotecnología, Biomedicina Y Bioinformática

Bioinformática en España

Grupos de investigación

Asociaciones

BioInformaticsGRX (RSG Spain Granada) Comunidad granadina para el estudio y el desarrollo de la bioinformática.

ISCB-RSG España Nodo ISCB Regional Student Group España

Bioinformática en México

Bioinformatics in Mexico: A diagnostic from the academic perspective and recommendations for a public policy Publicación realizada en Plos Computational Biology Journal sobre la situación de la Bioinformática y la Biología computacional en México.

Grupos de investigación

Asociaciones

RSG - México

Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB)

Bioinformática en Paraguay

Grupos de investigación

Laboratorio de Bioinformática, Núcleo de Investigación y Desarrollo Tecnológico (NIDTEC)

Asociaciones

Bioinformática en Perú

Grupos de investigación

Asociaciones

Sociedad Peruana de Bioinformática

Bioinformática en Uruguay

Grupos de investigación

Unidad de Bioinformática Hugo Naya - Institut Pasteur de Montevideo (IP Montevideo)

Asociaciones

Bioinformática en Venezuela

Grupos de investigación

Asociaciones

RSG Venezuela Estudiantes de Bioinformática y Biología Computacional de Venezuela

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