Added comments to thermo file, corrected adjlists

ReactionMechanismGenerator · Sep 12, 2016 · 57a92b1 · 57a92b1
1 parent aa0f713
commit 57a92b1
Show file tree

Hide file tree

Showing 2 changed files with 278 additions and 170 deletions.
diff --git a/input/kinetics/libraries/FFCM1(-)/dictionary.txt b/input/kinetics/libraries/FFCM1(-)/dictionary.txt
@@ -1,166 +1,142 @@
-CH2(S)
-1 C u0 p1 c0 {2,S} {3,S}
-2 H u0 p0 c0 {1,S}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
+Ar
+1 Ar u0 p4 c0
 
-CH3OH
-1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
-2 O u0 p2 c0 {1,S} {6,S}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 H u0 p0 c0 {1,S}
-6 H u0 p0 c0 {2,S}
+He
+1 He u0 p1 c0
 
-CH2O
-1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,S} {4,S}
-2 O u0 p2 c0 {1,D}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
+N2
+1 N u0 p1 c0 {2,T}
+2 N u0 p1 c0 {1,T}
 
-CH2OH
-multiplicity 2
-1 C u1 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S}
-2 O u0 p2 c0 {1,S} {5,S}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 H u0 p0 c0 {2,S}
+H2
+1 H u0 p0 c0 {2,S}
+2 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-CH3CO
+H
 multiplicity 2
-1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
-2 C u1 p0 c0 {1,S} {6,D}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 H u0 p0 c0 {1,S}
-6 O u0 p2 c0 {2,D}
+1 H u1 p0 c0
+
+O
+multiplicity 3
+1 O u2 p2 c0
 
 O2
 multiplicity 3
 1 O u1 p2 c0 {2,S}
 2 O u1 p2 c0 {1,S}
 
-CH2CHO
+OH
 multiplicity 2
-1 C u0 p0 c0 {2,D} {4,S} {5,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,D} {3,S} {6,S}
-3 O u1 p2 c0 {2,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 H u0 p0 c0 {1,S}
-6 H u0 p0 c0 {2,S}
+1 O u1 p2 c0 {2,S}
+2 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-C2H4
-1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,S} {4,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,D} {5,S} {6,S}
+H2O
+1 O u0 p2 c0 {2,S} {3,S}
+2 H u0 p0 c0 {1,S}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
+
+HO2
+multiplicity 2
+1 O u0 p2 c0 {2,S} {3,S}
+2 O u1 p2 c0 {1,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 H u0 p0 c0 {2,S}
-6 H u0 p0 c0 {2,S}
 
 H2O2
 1 O u0 p2 c0 {2,S} {3,S}
 2 O u0 p2 c0 {1,S} {4,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-C2H2
-1 C u0 p0 c0 {2,T} {3,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,T} {4,S}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {2,S}
+CO
+1 C u0 p1 c-1 {2,T}
+2 O u0 p1 c+1 {1,T}
+
+CO2
+1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,D}
+2 O u0 p2 c0 {1,D}
+3 O u0 p2 c0 {1,D}
+
+C
+multiplicity 5
+1 C u4 p0 c0
+
+CH
+multiplicity 4
+1 C u3 p0 c0 {2,S}
+2 H u0 p0 c0 {1,S}
 
 CH2
 multiplicity 3
 1 C u2 p0 c0 {2,S} {3,S}
 2 H u0 p0 c0 {1,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 
+CH2(S)
+1 C u0 p1 c0 {2,S} {3,S}
+2 H u0 p0 c0 {1,S}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
+
 CH3
 multiplicity 2
 1 C u1 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S}
 2 H u0 p0 c0 {1,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-HO2
-multiplicity 2
-1 O u0 p2 c0 {2,S} {3,S}
-2 O u1 p2 c0 {1,S}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
-
 CH4
 1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
 2 H u0 p0 c0 {1,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 5 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-C2H
+HCO
 multiplicity 2
-1 C u0 p0 c0 {2,T} {3,S}
-2 C u1 p0 c0 {1,T}
+1 C u1 p0 c0 {2,D} {3,S}
+2 O u0 p2 c0 {1,D}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-HCCO
-multiplicity 2
-1 C u0 p0 c0 {2,T} {4,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,T} {3,S}
-3 O u1 p2 c0 {2,S}
+CH2O
+1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,S} {4,S}
+2 O u0 p2 c0 {1,D}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-He
-1 He u0 p1 c0
-
-C
-multiplicity 5
-1 C u4 p0 c0
-
-CH
-multiplicity 4
-1 C u3 p0 c0 {2,S}
-2 H u0 p0 c0 {1,S}
-
-CO
-1 C u0 p1 c-1 {2,T}
-2 O u0 p1 c+1 {1,T}
-
-H
+CH2OH
 multiplicity 2
-1 H u1 p0 c0
-
-O
-multiplicity 3
-1 O u2 p2 c0
+1 C u1 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S}
+2 O u0 p2 c0 {1,S} {5,S}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-CH3CHO
+CH3O
+multiplicity 2
 1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,S} {6,D} {7,S}
+2 O u1 p2 c0 {1,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 5 H u0 p0 c0 {1,S}
-6 O u0 p2 c0 {2,D}
-7 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-C2H6
+CH3OH
 1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,S} {6,S} {7,S} {8,S}
+2 O u0 p2 c0 {1,S} {6,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 5 H u0 p0 c0 {1,S}
 6 H u0 p0 c0 {2,S}
-7 H u0 p0 c0 {2,S}
-8 H u0 p0 c0 {2,S}
-
-N2
-1 N u0 p1 c0 {2,T}
-2 N u0 p1 c0 {1,T}
 
-CH3O
+C2H
 multiplicity 2
-1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
-2 O u1 p2 c0 {1,S}
+1 C u1 p0 c0 {2,T}
+2 C u0 p0 c0 {1,T} {3,S}
+3 H u0 p0 c0 {2,S}
+
+C2H2
+1 C u0 p0 c0 {2,T} {3,S}
+2 C u0 p0 c0 {1,T} {4,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
-4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 H u0 p0 c0 {1,S}
+4 H u0 p0 c0 {2,S}
 
 C2H3
 multiplicity 2
@@ -170,54 +146,79 @@ multiplicity 2
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 5 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-HCO
+C2H4
+1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,S} {4,S}
+2 C u0 p0 c0 {1,D} {5,S} {6,S}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 H u0 p0 c0 {2,S}
+6 H u0 p0 c0 {2,S}
+
+C2H5
 multiplicity 2
-1 C u1 p0 c0 {2,D} {3,S}
-2 O u0 p2 c0 {1,D}
+1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
+2 C u1 p0 c0 {1,S} {6,S} {7,S}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 H u0 p0 c0 {1,S}
+6 H u0 p0 c0 {2,S}
+7 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-CO2
-1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,D}
-2 O u0 p2 c0 {1,D}
-3 O u0 p2 c0 {1,D}
+C2H6
+1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
+2 C u0 p0 c0 {1,S} {6,S} {7,S} {8,S}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 H u0 p0 c0 {1,S}
+6 H u0 p0 c0 {2,S}
+7 H u0 p0 c0 {2,S}
+8 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-OH
+HCCO
 multiplicity 2
-1 O u1 p2 c0 {2,S}
-2 H u0 p0 c0 {1,S}
-
-H2
-1 H u0 p0 c0 {2,S}
-2 H u0 p0 c0 {1,S}
+1 C u0 p0 c0 {2,T} {4,S}
+2 C u0 p0 c0 {1,T} {3,S}
+3 O u1 p2 c0 {2,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
 
-H2CC
+CH2CO
 1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,S} {4,S}
-2 C u0 p1 c0 {1,D}
+2 C u0 p0 c0 {1,D} {5,D}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 O u0 p2 c0 {2,D}
 
-H2O
-1 O u0 p2 c0 {2,S} {3,S}
-2 H u0 p0 c0 {1,S}
-3 H u0 p0 c0 {1,S}
+CH2CHO
+multiplicity 2
+1 C u0 p0 c0 {2,D} {4,S} {5,S}
+2 C u0 p0 c0 {1,D} {3,S} {6,S}
+3 O u1 p2 c0 {2,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 H u0 p0 c0 {1,S}
+6 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-Ar
-1 Ar u0 p4 c0
+CH3CHO
+1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
+2 C u0 p0 c0 {1,S} {6,D} {7,S}
+3 H u0 p0 c0 {1,S}
+4 H u0 p0 c0 {1,S}
+5 H u0 p0 c0 {1,S}
+6 O u0 p2 c0 {2,D}
+7 H u0 p0 c0 {2,S}
 
-C2H5
+CH3CO
 multiplicity 2
 1 C u0 p0 c0 {2,S} {3,S} {4,S} {5,S}
-2 C u1 p0 c0 {1,S} {6,S} {7,S}
+2 C u1 p0 c0 {1,S} {6,D}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
 5 H u0 p0 c0 {1,S}
-6 H u0 p0 c0 {2,S}
-7 H u0 p0 c0 {2,S}
+6 O u0 p2 c0 {2,D}
 
-CH2CO
+H2CC
+multiplicity 3
 1 C u0 p0 c0 {2,D} {3,S} {4,S}
-2 C u0 p0 c0 {1,D} {5,D}
+2 C u2 p0 c0 {1,D}
 3 H u0 p0 c0 {1,S}
 4 H u0 p0 c0 {1,S}
-5 O u0 p2 c0 {2,D}