This workshop consists of three notebooks working on three datasets but the last notebook is FYI, the hands-on bits are within the first two notebooks.
The theory part is available here:
The original theory part in Spanish is available here:
We will be using the migration data through satellite telemetry for African cuckoos in Nigeria, kindly released by Iwajomo SB et al, 2018 as part of the movebank.org data repository. It contains 12,563 tracking points for six individuals, from May 29th, 2013 until Jun 28th, 2017.
We will look into the problem of predicting whether a bird will move in the next two hours.
Population prediction using data provided by the World Bank and the number of links a Wikipedia for the country receives. Exemplifies using previous values of the target feature.
Using data derived from the DBpedia graph for different versions, we will look into imputing large number of missing historical data.
(basada en las instrucciones provistas por la organización de RIIAA'20, el instructor no usa Conda ni Anaconda)
Cosas para preparar
- Una laptop.
- Este repositorio de GitHub clonado y actualizado antes del taller.
- Un sentido aventurero en los datos.
- Un ambiente Python 3.7+ con Anaconda (ver opciones 1 y 2 abajo).
Los talleres serán impartidos usando notebooks de Jupyter, documentos con código ejecutable, texto, ecuaciones, visualizaciones, imágenes y demás material. Los notebooks se pueden crear y ejecutar en la nube vía Google Colab (opción 1) o de manera local en tu computadora a través de Jupyter Notebooks (opción 2).
Colab es un servicio de Google para ejecutar notebooks en la nube. Provee ambientes de Python 2 y 3 con CPUs, GPUs y TPUs. Solo necesitas tener una cuenta de Google o crear una.
Recomendamos que elijas un ambiente con Python 3 y GPU. Para activarlo:
- Abre el menú
Entorno de ejecución - Elige la opción
Restablecer todos los entornos de ejecución.... - Vuelve a abrir
Entorno de ejecución - Elige
Cambiar tipo de entorno de ejecución - Selecciona Python 3 como
Tipo de ejecucióny GPU de la lista deAcelerador por hardware
La siguiente captura de pantalla ilustra este proceso.
En Colab puedes crear un nuevo notebook, subir uno existente desde tu computadora o importarlo de Google Drive o GitHub.
Para tener la versión de Python 3.7+ y todas las bibliotecas instaladas en cualquier plataforma, la organización de RIIAA'20 recomienda que uses Anaconda y generes un ambiente con el archivo environment.yml de este repositorio usando una terminal y el comando:
conda env create -n riiaa20 -f environment.yml
Cambia el nombre riia20 por tu nombre favorito para el ambiente.
Para activar el ambiente que creaste, en una terminal ingresa el comando
conda activate riiaa20
Una vez activado, puedes ejecutar la aplicación de Jupyter Notebook
jupyter notebook
Este comando abrirá una pestaña o ventana en tu navegador web, como se muestra en la siguiente captura de pantalla:
Al igual que en Google Colab, puedes crear un nuevo notebook seleccionando el botón New y posteriormente Python 3. De forma alternativa, puedes abrir uno existente seleccionando el archivo del notebook (con extensión .ipynb) dentro del directorio donde ejecutaste Jupyter Notebook. Con el botón Upload agregas archivos que se encuentran en otra parte de tu computadora a este directorio. Para cerrar Jupyter Notebook, presiona el botón Quit y posteriormente cierra la pestaña o ventana de tu navegador web.
Para desactivar el ambiente riiaa20 de Anaconda simplemente haz
conda deactivate
Siguiendo el README del código del libro.
python3 -m venv feateng source ./feateng/bin/activate
pip3 install jupyter pip3 install ipykernel pip3 install scikit-learn pip3 install lxml pip3 install numpy pip3 install scipy pip3 install matplotlib pip3 install graphviz
pip3 install geopy pip3 install folium
python -m ipykernel install --user --name feateng jupyter notebook --no-browser .