SeremiSaludAysenCovid
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Multiples archivos ipynb contienen datos analizados para obtener gráficos a presentar, tales como:
Datos de incidencia por comuna, disponible en reporte_seremi_aysen:
.png?raw=true)
Casos probables o Confirmados por comuna, disponible en reporte_seremi_aysen:
.png?raw=true)
Porcentaje BAC, disponible en reporte_seremi_aysen:
.png?raw=true)
Test PCR realizados, disponible en reporte_seremi_aysen:
.png?raw=true)
Positividad de PCR, disponible en reporte_seremi_aysen:
.png?raw=true)
Capacidad de investigación en 48h, disponible en tasas_incidencia:
.png?raw=true)
Evolución de variantes principales, disponible en informe_variantes:
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Incidencia por comuna, disponible en tasas_incidencia:
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Gráficos de Indicadores para comparación intercomunal, disponible en indicadores_por_comuna:
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Para tener una copia local y funcional sigue los siguientes simples pasos.
Este es un ejemplo de como instalar las librerias necesarias para utilizar el software correctamente.
- pip
pip install requirements.txt
Para usuarios de Anaconda
Un nuevo ambiente virtual debe ser generado para correr los scripts en modo compatibilidad con Python 3.8.1. Para esto correr en el Anaconda prompt
conda create -n virtualseremiaysen python=3.8.1 anacondaEsto puede tardar unos minutos si es la primera vez que creas el ambiente virtual.
Posterior a la creación del ambiente virtual debemos activarlo e instalar las librerias necesarias
conda activate virtualseremiaysenAhora tienes todo instalado para continuar, solo abre tu instancia de Jupyter
jupyter notebookLas librerias necesarias serán instaladas directamente desde el Notebook mediante !pip install YourPackage, una vez instaladas en el ambiente virtual dichas lineas pueden ser comentadas
Para simplificar la vida del usuario se creó un archivo requirements_to_install.ipynb
el cual contiene la linea de código yá escrita. Dicho archivo debe ser corrido una vez previo al uso de los otros
pip install -r requirements.txtEn este punto debieras ser capaz de usar todos los archivos sin problemas
Para finalzar, siempre recuerda detener tu ambiente virtual una vez que dejes de usarlo
conda deactivate- Clona el repositorio
git clone https://github.com/millacurafa/SeremiSaludAysenCovid.git
- Instala los paquetes de Python necesarios
pip install -r requirements.txt
Los documentos estan presentes en formato Jupyter notebook *.ipynb y pueden ser corridos de manera local si las bases de datos son agregadas correctamente en la carpeta data.
La forma más simple de uso es instalar el ambiente virtual de Anaconda y posteriormente plotly el cual no viene incluido. Adicionalmente, se podrian instalar los requerimientos manualmente como se explica en la sección anterior de Instalación.
Celdas pueden ser corridas haciendo click en Kernel y luego Restart & Run All, o una por una mediante Shift+Enter o Ctrl+Enter/Cmd+Enter
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Mayor información disponible dentro de cada archivo
Éxito en tu exploración!
Revisa open issues para ver una lista de las caracteristicas propuestas (y errores conocidos).
Las contribuciones son lo que hacen la comunidad de código abierto un excelente lugar de aprendizaje, inspiración y creación. Cualquier contribución que realices será muy bien recibida
- Realiza un Fork del Proyecto
- Crea una rama para tu Feature (
git checkout -b feature/AmazingFeature) - Haz un Commit de tus cambios (
git commit -m 'Agrega un AmazingFeature') - Haz Push de la rama creada (
git push origin feature/AmazingFeature) - Abre una solicitud de Pull
Distribuido bajo licencia MIT. Ver LICENSE para mayor información.
Link del proyecto: https://github.com/millacurafa/SeremiSaludAysenCovid