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IJCAI

IJCAI 2015

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注
医学报告术语自动检测	2015	IJCAI	Information Extraction of Texts in the Biomedical Domain	NLP	方法
本体流中的知识发现	2015	IJCAI	Scalable Maintenance of Knowledge Discovery in an Ontology Stream	无	综述
基因表达数据的双聚类	2015	IJCAI	Biclustering Gene Expressions Using Factor Graphs and the Max-Sum Algorithm	二元因子图、Max Sum算法	方法
医学同义词抽取	2015	IJCAI	Medical Synonym Extraction with Concept Space Models	半监督、Word2Vec	方法

IJCAI 2016

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注
生物医疗文本中不良药物时间提取	2016	IJCAI	Joint Models for Extracting Adverse Drug Events from Biomedical Text	CNN	方法，GitHub开源
利用分子机器人群体进行治疗	2016	IJCAI	Rule-Based Programming of Molecular Robot Swarms for Biomedical Applications	Athelas、Bilbo	理论
蛋白质二级结构预测	2016	IJCAI	Protein Secondary Structure Prediction Using Cascaded Convolutional and Recurrent Neural Networks	端到端DNN（CNN、RNN）	方法
利用EHR进行药物重定位	2016	IJCAI	Baseline Regularization for Computational Drug Repositioning with Longitudinal Observational Data	正则化	方法

IJCAI 2017

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注
解决基因组数据的高维度麻烦	2017	IJCAI	Breaking the curse of dimensionality for machine learning on genomic data	随机森林	方法
改进OTUs结果的质量和表示	2017	IJCAI	A De Novo Robust Clustering Approach for Amplicon-Based Sequence Data	聚类	方法
生物声音分类	2017	IJCAI	JSI Sound – a machine-learning tool in Orange for simple biosound classification	6种ML方法	工具
生存分析、存活率分析	2017	IJCAI	Feature Selection and Deep Learning for Survival Analysis	迭代贝叶斯平均、DNN	方法

IJCAI 2018

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注
药物可解释的相似度度量	2018	IJCAI	Drug Similarity Integration Through Attentive Multi-view Graph Auto-Encoders	自编码、多视图、注意力	方法
DTIs预测，端到端可解释	2018	IJCAI	Interpretable Drug Target Prediction Using Deep Neural Representation	端到端DNN、注意力	方法
预测慢性病的演变速度	2018	IJCAI	Predicting the Spatio-Temporal Evolution of Chronic Diseases in Population with Human Mobility Data	协同主题、高斯混合模型	方法
跨模态生物医学图像分割	2018	IJCAI	Unsupervised Cross-Modality Domain Adaptation of ConvNets for Biomedical Image Segmentations with Adversarial Loss	CNN、对抗	方法

IJCAI 2019

暂未全部公布

RECOMB

RECOMB 2014

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注	重要性评分	是否药物重定位
蛋白质相互作用的设计和特异性	2014	RECOMB	Learning Sequence Determinants of Protein: Protein Interaction Specificity with Sparse Graphical Models	图模型	方法	2	否
基于序列的蛋白质同源性检测	2014	RECOMB	MRFalign: Protein Homology Detection through Alignment of Markov Random Fields	马尔可夫随机场、位置特异得分矩阵	方法	1	否
癌症通路推断	2014	RECOMB	Simultaneous Inference of Cancer Pathways and Tumor Progression from Cross-Sectional Mutation Data	贝叶斯网络	方法，TCGA数据	2	否
蛋白质功能预测	2014	RECOMB	Correlated Protein Function Prediction via Maximization of Data-Knowledge Consistency	多标签分类、矩阵分解	方法	2	否
蛋白质结构对齐	2014	RECOMB	Bayesian Multiple Protein Structure Alignment	贝叶斯统计、MCMC	方法	1	否

RECOMB 2015

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注	重要性评分	是否药物重定位
基因组非编码DNA序列的顺式调控元件信息特征发现	2015	RECOMB	Deep Feature Selection: Theory and Application to Identify Enhancers and Promoters	DNN、特征选择	1	否
多药物多靶点DTI预测	2015	RECOMB	Deciding When to Stop: Efficient Experimentation to Learn to Predict Drug-Target Interactions	核化贝叶斯矩阵分解	方法	3	是

RECOMB 2016

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注	重要性评分	是否药物重定位
蛋白质病毒间相互作用	2016	RECOMB	Multitask Matrix Completion for Learning Protein Interactions Across Diseases	多任务矩阵	方法	1	否
互斥癌症通路和依赖关系的联合推断	3016	RECOMB	pathTiMEx: Joint Inference of Mutually Exclusive Cancer Pathways and Their Dependencies in Tumor Progression	MCMC、概率生成模型	方法	1	否

RECOMB 2017

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注	重要性评分	是否药物重定位

RECOMB 2018

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注	重要性评分	是否药物重定位
新的图编辑距离	2018	RECOMB	GTED: Graph Traversal Edit Distance	无	理论	1	否
元基因组微生物分类	2018	RECOMB	Accurate Reconstruction of Microbial Strains from Metagenomic Sequencing Using Representative Reference Genomes	概率模型，聚类	方法	2	否

RECOMB 2019

文章简介	发表时间	会议来源	文献名	机器学习方法	文章备注	重要性评分	是否药物重定位
非结构化本体论文本概念识别	2019	RECOMB	Identifying Clinical Terms in Free-Text Notes Using Ontology-Guided Machine Learning	CNN	方法	1	否