顶刊Figure复现合集 热图篇​

[ixxmu]

https://mp.weixin.qq.com/s/TgycXV67CvAUoJGGwneL6w

[ixxmu]

顶刊Figure复现合集 热图篇​ by 在生信的坑里挖呀挖呀挖

顶刊Figure复现合集 热图篇

《科研的“争先恐后”》，这是个合集系列。

之前整理过数据库相关的，有了

《科研的“争先恐后”，数据库这条捷径》

《科研的“争先恐后”，数据库这条捷径(2)》

期刊同款图绘制也写过不少，所以有了绘图合集。就从5篇热图开始吧，各式各样的。

Cell同款

、

知识点

1. 学会用ComplexHeatmap绘热图

2. 学会给热图标记特定基因

3. 学会基因和样本进行分类或分组，也就是行和列添加注释

4. 学会处理有特殊字符的输入文件
   

Cancer Cell同款

知识点

1. 学会用pheatmap绘制热图

2. 标记特定基因

3. 添加显著性标记，也就是热图色块添加文本

Molecular Therapy同款

知识点

1. 学会用ComplexHeatmap绘热图

2. 标记个别重点基因

3. 设置基因聚类

4. 添加样本的分组

Int J Biol Sci同款

知识点

1. 学会用corrplot绘制基因相关性热图

2. 学会计算相关性

3. 学会展示特定的相关性值

Cell同款

、学会了画热图，再看下画啥样的热图，今天就以发在Cell上的Figure为例，都是Cell里的热图噢，果然配色很常见，样式很典型。详见《Cell同款 | 配色 热图篇》

往期精彩回顾

• 生信实用技能盘点 | readlink
  

• 不做科研小迷糊 | mast好像不属于粒细胞诶
  
• MSigDB，GSEA的不二搭档
• 空间转录组，“卷”你出圈
• 搞技术的人，也可爱
  
• 单细胞分析工具大全
  
• 不讲寻常话，CellMarker2.0真干货！
  
• Cell Research同款 | 正负柱状图
  
• Nature Communications同款 | 桑基图
• Cell同款 | 小提琴图
  
  

---

今天的话

我用尽了全力，过着平凡的一生。