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话廿八 | 当人人都会生物信息 #6004

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ixxmu opened this issue Nov 22, 2024 · 1 comment
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话廿八 | 当人人都会生物信息 #6004

ixxmu opened this issue Nov 22, 2024 · 1 comment

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ixxmu commented Nov 22, 2024

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ixxmu commented Nov 22, 2024

话廿八 | 当人人都会生物信息 by 单细胞天地


赛尔,你好。

这是生信家书的第二十八封。虽然习惯了四季轮回,但是当新的季节来临,还是会有些欣欣然。就拿着越来越冷的冬天来说吧,当树的颜色换了个遍,衣橱里的衣服 也都换成新的风格,某一天的早上,打开门,一个雕栏玉砌的世界。不免会有些喜出望外。每到这个场景,我都想起《钢铁是怎样炼成的》里面的一个画面:

青春终于胜利了,保尔没有死于伤寒。这是他第四次跨过死亡的门槛,又回到了人间。卧床一个月之后,苍白瘦削的保尔终于站起来,迈着颤巍巍的双腿,扶着墙壁,在房间里试着走动。母亲搀着他走到窗口,他向路上望了很久。 
积雪融化了,小水洼闪闪发光。外面已经是乍暖还寒的早春天气了。
紧靠窗户的樱桃树枝上,神气十足地站着一只灰胸脯的麻雀,它不时用狡猾的小眼睛偷看保尔。
“怎么样,冬天咱们总算熬过来了吧?”保尔用指头敲着窗户,低声说。

一切都会过去,而且会好起来。每到心中积郁,都会这样安慰自己。这两天无意间看到的一句话,居然没来由地感到很是治愈:

天地不与圣人同忧。

这里面有两层意思,一个是天地和圣人都各有其忧,另一个是,就算是圣人,也不能把天地之间的心操完,何况我们一介凡夫呢?

其实大部分的忧愁都是自己假想的,在我们做生物信息数据分析的时候也是一样。那种坐在电脑前,行云流水地编程,按部就班地导出结果,顺利地拿去回报/发表,此类情况很少见。更多地是数据反复,不断调整,胆大心细脸皮厚。

曾经我们认为数据处理的难,是因为生物信息人手不够,假如人人都会生物信息,会是一个怎样的世界,生物信息会更好做吗?

就像前几年互联网流传的“人人都是产品经理”一样,产品经理没有因此更好做,只是入门的门槛降低了,泥沙俱下,什么是产品经理,反而不容易判断了。

随着生物信息高等教育的普及,大量的测序服务公司成批制地生产生物信息工程师,以至于生物信息的门槛也很低了。测序这个技术也慢慢从科研级别到临床级别,并有零星的消费级别产品面世。

于是,熟悉Linux和R/Python,能加载几个数据分析工具包,跑通官方文档,会用人工智能提示词,就说自己会生物信息了。(这说的不就是我吗?)

当人人都是生物信息,我们不再重要,生物信息的门槛降低,生物信息本身也会进一步分化成不同的领域,如生物信息的上下游分析。举个例子,大部分的单细胞生物信息入门者,上来就是单细胞下游分析了,因为上游分析的序列质控、数据比对、基因定量都由商业开源工具完成了。对很多下游生物信息来讲,越上游越自由,这要求上下游生物信息者们更加紧密合作。生物信息岗位也由一个人,慢慢演变成一个小团队。生物信息的工具属性更加明显。

当人人都是生物信息,科学家之间的沟通更加顺畅。生物信息依托于互联网构建起来的开源社区,将为人人所用,大家的语言也更加接近。君不见,多少测序数据分析的老师,希望直接和生物信息沟通,甚至坐在生物信息分析师旁边。到那时,我们用生物信息就像用Excel和PPT那样自然、顺手、高效、随处可见。

当人人都是生物信息,生物信息的稀缺性改变了,依然会有稀缺的生物信息者,但是入门的生物信息将没有那么多“门槛红利”了。还记得早些年招聘生物信息的时候,只要愿意学就行,基础不重要。现在基本上都要求熟悉编程语言、分析过大项目,等等。那种会了就稀缺的时代过去了,混生物信息,要有硬通货了。

当人人都是生物信息,生物信息依然要爱惜自己的羽毛,对数据负责,向结果负责。依然做那个独一无二的生物信息。


你的运来
20241121
于南京


@ixxmu ixxmu changed the title archive_request 话廿八 | 当人人都会生物信息 Nov 22, 2024
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