分类变量也可以计算相关性！

docs/2024-11/分类变量也可以计算相关性_.md

@@ -0,0 +1,15 @@
+---
+title: "分类变量也可以计算相关性！"
+date: 2024-11-19T00:04:37Z
+draft: ["false"]
+tags: [
+  "fetched",
+  "R语言生信医学统计与科研"
+]
+categories: ["Acdemic"]
+---
+分类变量也可以计算相关性！ by R语言生信医学统计与科研
+------
+<div><p>对于分类变量来说，如果是有序分类变量，可以使用Wilcoxon秩和检验，推断各等级强度的差异；对于无序分类变量，可以使用卡方检验/Fisher精确检验，比较频数分布的差异。上述这些统计检验，可以解释为列联表中行列变量是否存在统计学的差异（是否显著相互影响），但是无法给出相关性（关联）的强度或方向。</p><p>接下来，我们来讲解一下常见的用于统计列联表中行列变量相关性的系数：（1）Phi-coefficient，只适用于2X2的四格列联表，取值为[-1， 1]。其中，1表示强正相关，-1表示强负相关；（2）Pearson contingency coefficient，是Phi-coefficinet的矫正和推广，可以用于多维列联表资料，取值为[0,1]；（3）Cramer`s V coefficient，是对行列数量不同时，对Pearson contingency coefficient的矫正，<span>取值为[0,1</span><span>]，该系数不受样本量的限制。</span><br></p><p><span>在R中，可以通过 vcd 包来实现。<br></span></p><section><ul><li><li><li><li><li><li><li><li><li><li><li><li><li><li><li></ul><pre data-lang="properties"><code><span><span>&gt;</span> <span>library(vcd)</span></span></code><code><span><span>&gt;</span> <span>tab &lt;- table(lung$sex, lung$ph.ecog)</span></span></code><code><span><span>&gt;</span> <span>tab</span></span></code><code><span>   </span></code><code><span>     <span>0</span>  <span>1  2  3</span></span></code><code><span>  <span>1</span> <span>36 71 29  1</span></span></code><code><span>  <span>2</span> <span>27 42 21  0</span></span></code><code><span><span>&gt;</span> <span>assocstats(tab)</span></span></code><code><span>                    <span>X^2</span> <span>df P(&gt; X^2)</span></span></code><code><span><span>Likelihood</span> <span>Ratio 1.6863  3  0.63998</span></span></code><code><span><span>Pearson</span>          <span>1.3341  3  0.72105</span></span></code><code><span><br></span></code><code><span><span>Phi-Coefficient</span>   : <span>NA </span></span></code><code><span><span>Contingency</span> <span>Coeff.: 0.076 </span></span></code><code><span><span>Cramer's</span> <span>V        : 0.077</span></span></code></pre></section><p>解读：</p><ul><li><p><span>Likelihood Ratio：似然比卡方检验</span></p></li><li><p><span>Pearson：皮尔森卡方检验<br></span></p></li><li><p><span>Phi-Coefficient：只适用于2x2的四格列联表，这里不适用，输出NA</span></p></li><li><p><span>Contingency Coeff.：列联系数</span></p></li><li><p><span>Cramer's V：克莱姆相关系数</span></p></li></ul><p><mp-style-type data-value="3"></mp-style-type></p></div>  
+<hr>
+<a href="https://mp.weixin.qq.com/s/jbM1MO2LWmoxZCTEUPmvFQ",target="_blank" rel="noopener noreferrer">原文链接</a>