From 26215c6e8f139e520bb2bc6a3eb73951e0458563 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: ixxmu Date: Sat, 23 Nov 2024 14:33:55 +0000 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?=E9=A1=B6=E5=88=8AFigure=E5=A4=8D=E7=8E=B0?= =?UTF-8?q?=E5=90=88=E9=9B=86=20=E7=83=AD=E5=9B=BE=E7=AF=87=E2=80=8B?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- ...\206_\347\203\255\345\233\276\347\257\207_.md" | 15 +++++++++++++++ 1 file changed, 15 insertions(+) create mode 100644 "docs/2024-11/\351\241\266\345\210\212Figure\345\244\215\347\216\260\345\220\210\351\233\206_\347\203\255\345\233\276\347\257\207_.md" diff --git "a/docs/2024-11/\351\241\266\345\210\212Figure\345\244\215\347\216\260\345\220\210\351\233\206_\347\203\255\345\233\276\347\257\207_.md" "b/docs/2024-11/\351\241\266\345\210\212Figure\345\244\215\347\216\260\345\220\210\351\233\206_\347\203\255\345\233\276\347\257\207_.md" new file mode 100644 index 00000000..ad0d6910 --- /dev/null +++ "b/docs/2024-11/\351\241\266\345\210\212Figure\345\244\215\347\216\260\345\220\210\351\233\206_\347\203\255\345\233\276\347\257\207_.md" @@ -0,0 +1,15 @@ +--- +title: "顶刊Figure复现合集 热图篇​" +date: 2024-11-23T14:32:13Z +draft: ["false"] +tags: [ + "fetched", + "在生信的坑里挖呀挖呀挖" +] +categories: ["Acdemic"] +--- +顶刊Figure复现合集 热图篇​ by 在生信的坑里挖呀挖呀挖 +------ +

顶刊Figure复现合集 热图篇

《科研的“争先恐后”》,这是个合集系列。

之前整理过数据库相关的,有了

《科研的“争先恐后”,数据库这条捷径》

《科研的“争先恐后”,数据库这条捷径(2)》

期刊同款图绘制也写过不少,所以有了绘图合集。就从5篇热图开始吧,各式各样的。

Cell同款


知识点
  1. 学会用ComplexHeatmap绘热图

  2. 学会给热图标记特定基因

  3. 学会基因和样本进行分类或分组,也就是行和列添加注释

  4. 学会处理有特殊字符的输入文件

Cancer Cell同款



知识点
  1. 学会用pheatmap绘制热图

  2. 标记特定基因

  3. 添加显著性标记,也就是热图色块添加文本

Molecular Therapy同款



知识点
  1. 学会用ComplexHeatmap绘热图

  2. 标记个别重点基因

  3. 设置基因聚类

  4. 添加样本的分组

Int J Biol Sci同款



知识点

  1. 学会用corrplot绘制基因相关性热图

  2. 学会计算相关性

  3. 学会展示特定的相关性值

Cell同款

学会了画热图,再看下画啥样的热图,今天就以发在Cell上的Figure为例,都是Cell里的热图噢,果然配色很常见,样式很典型。详见Cell同款 | 配色 热图篇

往期精彩回顾


今天的话

我用尽了全力,过着平凡的一生。

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