shrimp.mf

# Workflow generated by "./make_shrimp_workflow query.csfasta genome.fasta output.txt 10000"
# query.csfasta has 7617557 sequences
# splitting into 762 files of 10000 each

OPTIONS=-M fast -M 50bp

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	LOCAL ./split_fasta 10000 query.csfasta

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output.43: query.csfasta.43 genome.fasta rmapper-cs
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