重复序列trf注释

[CrawlingSponge]

陈老师 您好！
关于geta重复序列在注释当中，trf的注释向您请教一下。我试过哺乳动物的几个注释，应该是有不到10%的trf是属于trf的序列，geta当中是不是可以将这部分添加进去？

[chenlianfu]

GETA目前没有添加常规TRF类型的重复序列注释。原因是，重复单元碱基数较长的Tandem Repeat Sequence上存在编码基因的可能性较大。RepeatMasker软件也仅调用了TRF分析Simple_Repeat，但是没有分析重复单元较长的TRF。