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<div class="uni-logo"></div>
# Indice de Distribution de Biodiversité
<hr width="60%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
## Suivre les changements des aires <br/> de distribution des espèces du Québec dans le temps
### Vincent Bellavance, .small[étudiant à la maîtrise]
<div class="birds" >Photo by <a href="https://unsplash.com/@patriceb?utm_source=unsplash&utm_medium=referral&utm_content=creditCopyText" class="link_birds" >Patrice Bouchard</a> on <a style="font-size:10px;" href="https://unsplash.com/?utm_source=unsplash&utm_medium=referral&utm_content=creditCopyText" class="link_birds">Unsplash</a></div>
<br>
[<i class="fa fa-github fa-lg" style="color:#e7e8e2"></i> VincentBellavance/seminar2](https://github.com/VincentBellavance/seminar2)
[<i class="fa fa-twitter fa-lg" style="color:#e7e8e2"></i> @v_bellavance](https://twitter.com/v_bellavance)
---
# Changements de biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.pull-left[
]
.cite[CBD 2020]
<br><br>
.pull-right[
.font120[
- Parties de la **Convention** sur la **Diversité Biologique**
- 160 pays signataires
- 196 parties
- Vise la conservation de la biodiversité.
]
]
---
# Changements de biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.pull-left[
]
<br><br>
.pull-right[
]
.cite[CBD 2020]
???
---
# Changements de biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.pull-left[
]
<br><br>
.pull-right[
]
.cite[CBD 2020]
???
L'écriture de ces rapports ont amené beaucoup de chercheurs dans les dernières 15 années à développer des outils permettant de mesurer et visualiser les changements de biodiversité
---
# Les indicateurs de biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.center[
]
???
Mesurent des changements complexes et les représenter de manière simplifiée
---
# Les indicateurs de biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.center[
]
???
---
# Les indicateurs de biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.pull-left1[
.center2[
<br>
]
]
.pull-right1[
.font120[
- Compréhensible
<br>
- Communicable
<br>
- Mesure précise
]
]
???
Compréhensible pour les décideurs et le grand public (sert à vérififer l'atteinte d'objectifs et de sensibiliser).
Un des indicateurs les plus connus et les plus utilisés est sans aucun doute l'Indice Planète Vivante
---
# Indice Planète Vivante
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.font120[
- Mesure le changement moyen de la taille des populations de vertébrés depuis 1970
]
.cite[Collen et al. 2009 Conserv. Biol.]
--
.font120[
- Utilise les suivis de population à long terme:
- Mesure d'abondance d'une population au fil des ans
]
--
.font120[
- Peut-être calculé **globalement**, pour une **région précise** ou pour un **groupe taxonomique**
]
---
# Indice Planète Vivante
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.center[
]
.cite[WWF 2020]
???
Ici, figure du dernier rapport. Cette figure représente la diminution moyenne de la taille de population des vertébrés sur lequel on a des données.
---
# Indice des espèces canadiennes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.font120[**Environnement Canada**]
<br>
.center[
]
.cite[Environnement Canada [2019]]
???
Le développement de ces indices fait partie des engagements du Canada en matière de protection de la biodiversité
---
# Les suivis de biodiversité au Québec
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
- .font120[Orientations gouvernementales en matière de diversité biologique]
>.font120[**Évaluation** de la **biodiversité** et **élaboration** d’un **réseau de suivi**]
--
.center[
]
???
Présentement: Développement de Biodiversité Québec. Il n'existe aucun indicateur.
---
# Les suivis de biodiversité au Québec
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.pull-left[
]
<br>
.pull-right[
]
.cite[Berteaux et al. 2018 Sci. Rep.]
???
On s'attend à avoir des déplacements d'espèces provenant du sud.
Ces changements se produisent dans l'espace, prend un indicateur qui permet cette visulisation dans l'espace.
---
# Les suivis de biodiversité au Québec
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.pull-left[
]
.pull-right[
.font120[
- On ne peut pas extrapoler dans l'espace
- Peu de suivis de population à long terme
]
]
---
# Objectifs
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
>.font120[
.center[**Développer un indicateur de changements de biodiversité basé sur les données d'occurrences**]
]
--
<br>
>.font120[
.center[**Documenter les changements d'aires de distribution des espèces d'oiseaux présentes au Québec**]
]
<br>
>.font120[
.center[**Comparer les changements d'aires de distribution de divers groupes fonctionnels d'oiseaux du Québec**]
]
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class: middle, center, inverse
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
???
Explication du SDM: La Québec est divisé en grille avec des cellules d'une taille égale. On obtient une probabilité d'occurrence pour chaque cellule.
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# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
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# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
???
Base de données commencé en 2019, toujours en développement, notamment pour ce qui est de la validation des données et de la taxonomie, et de l'injection de données.
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# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.font120[
- **Standard d'informations** pour les observations sur la biodiversité au Québec
]
.font120[
- Proviennent de **plusieurs sources**:
- Gouvernementales
- Bases de données ouvertes (e.g. GBIF)
- Science citoyenne (e.g. eBird)
]
.font120[
- 130 millions d'occurrences de centaines d'espèces
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.pull-left-top[
.font120[
- eBird
- Atlas des Oiseaux Nicheurs
- Relevé des Oiseaux Nicheurs
]
]
.pull-right[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.pull-left-top[
.font120[
- Environ **huit millions** de points d'échantillonnages **exhaustifs**
- Moyenne de **260000 points/année**
- **282 espèces** d'oiseaux **nicheurs** du Québec
]
]
.pull-right[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.center[
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.center[
]
???
Tout est semblable dans ce cercle, mais les points les plus près sont plus semblables que ceux plus éloignés
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
<br>
.center[
]
???
Irrégularités d'échantillonnages entre les années, on prend des fenêtres temporelles afin d'obtenir des variations moins abruptes de l'indicateur.
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
???
Pour vous expliquer comment l'indicateur est calculé, je vais passer à travers un exemple avec le Cardinal Rouge
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# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.center[
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.center[
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.center[
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
#### Augmentation des aires de distribution
]
.div-top[
.center[
.pull-left-margin[
]
.pull-right[
]
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
#### Réductions des aires de distribution
]
.div-top[
.center[
.pull-left-margin[
]
.pull-right[
]
]
]
???
Ces changements peuvent être visualisés sur une carte, où chaque cellule à une valeur d'augmentation et de diminution. Ou on peut observer ces changements sur une série temporelle
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
#### Augmentation et diminution des aires de distribution
]
<br>
.div-top[
Augmentation: $\frac{E_t}{A_{t-1}}, \;\; E_t$ = Somme des augmentations
]
--
.div-top[
Diminution: $\frac{C_t}{A_{t-1}}, \;\; C_t$ = Somme des réductions
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.center[
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.center[
]
]
---
# Méthodes
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[]
.div-top[
.center[
]
]
---
class: middle, center, inverse
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
- 17 espèces:
- 11 **insectivores aériens**
- 6 **oiseaux de proie**
--
.center[
]
.cite[ICOAN 2019]
???
Initiative de conservation des oiseaux de l'amérique du nord
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
#### Objectifs: Documenter les changements d'aires de distribution
.center[
]
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
#### Objectifs: Documenter les changements d'aires de distribution
.pull-left[
]
.pull-right[
]
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
#### Objectifs: Documenter les changements d'aires de distribution
.center[
]
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
#### Objectifs: Comparer les groupes fonctionnels
.center[
]
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
---
# Résultats
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.pull-left[
]
.pull-right[
]
---
# Limites
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.font120[
- **Bruit** dans les modèles
]
--
.font120[
- Pratiquement **aucune information** pour le **nord du Québec**
]
--
.font120[
- **Aucune incertitude** sur l'indice
]
--
.font120[
- Données science citoyenne: **nombreux biais**
]
---
# Indicateur de Distribution de Biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
#### Objectif principal: Développer un indicateur de changements de biodiversité basé sur les données d'occurrences
.pull-left[
]
.pull-right[
.font120[
- Inclusion d'un **plus grand nombre d'espèces**
- **Grande couverture temporelle** pour **chaque espèce**
]
]
---
# Indicateur de Distribution de Biodiversité
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
#### Objectif principal: Développer un indicateur de changements de biodiversité basé sur les données d'occurrences
.pull-left[
.font120[
- Changements dans **l'espace**
- **Augmentations/réductions** d'aires de distribution
]
]
.pull-right[
]
---
# Applications potentielles
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.font120[
- Corrélations entre **augmentations/réductions** et facteurs **environnementaux** ou **anthropiques**
]
--
<br>
.font120[
- **Prédictions** de l'indice dans le temps
- Scénarios de **perturbations** ou **d'actions de conservation**
]
---
# Remerciements
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.pull-left[
.font120[**Superviseur:**]
Dominique Gravel
<br>
.font120[**Comité d’encadrement:**]
Isabelle Laforest-Lapointe
Mark Vellend
<br>
.font120[**Membres du laboratoire Gravel et de Biodiversité Québec**]
]
.pull-right[
]
---
# Méthodes du LPI
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
.center[
]
.cite[Buschke et al. 2021 Nat. Ecol. Evol.]
---
# Critiques du LPI
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
<br>
.center[
]
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# Critiques du LPI
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
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.center[
]
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# Critiques du LPI
<hr width="100%" align="left" size="1" color="orange"></hr>
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