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Is_it_in_ur_genes

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Is it in ur genes (CRYPTO)

In this challange we are given the following data :

0100 0100 1110 1111 0100 0010 0001 0000 1101 0001 1100 1101 0010 0110 0100 1111 0100 0000 1111 0100 1001 0010 0000 1110 0010 0011 1101 0001 0010 0001 1111 0100 0000 
1111 0110 0001 0010 0010 0000 1010 0000 1000 0011 1000 0001 0010 0011 1101 0011 0100 1010 1111 0100 1110 1010 0000 0001 0001 1100 1000 0011 0110 0011 0001 0000 0011 
0010 0010 0001 1111 0100 0100 0011 1011 1101 1011 1001 1011 1001 0111 1101 0011 0110 0010 1111 0101 0111 0110 1110 0101 1111 0110 0011 0010 1100 0000 1000 1111 1101 
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0011 0100 1010 1111 0100 0000 1111 0100 1001 0010 0000 1110 0010 0011 1101 0011 1110 0010 0011 0100 0011 1010 0000 0001 1000 1111 1101 0010 0000 0100 1000 1100 1011 
0010 0010 0010 1111 0101 0111 0110 1110 0101 1111 0100 1101 1000 1011 1101 0011 1110 0010 0011 0110 0011 0010 0000 0100 0011 1011 1111 1111 0110 1110 1010 0010 0010 
0001 0000 1110 0010 0111 1101 0010 0100 1000 0011 1000 1000 1111 0100 1000 1010 1100 1111 1000 1000 1000 1000 0110 0001 0001 0000 1101 0011 1011 1101 1000 1100 1011 
0010 0011 1101 1011 1001 1011 1001 0111 1101 0001 0010 0001 1111 0100 1010 0001 0010 0010 1000 0110 0011 1111 0100 0001 0011 0100 1111 0001 0000 1000 0000 1111 1101 
0001 0000 1110 1000 1100 1101 1111 0101 0111 0110 1110 0101 1111 1111 1101 0111 1000 1011 0010 0011 1101 0101 1101 1011 1001 0111 1101 0000 0100 0000 0011 1011 1101 
0000 1000 1000 1111 0100 0011 0001 0010 0010 0010 0000 0001 1000 1100 0111 1001 0011 1101 0010 1010 1000 0011 1000 0001 1000 1100 0100 0011 0100 1110 0000 0000 0111 
1111 0100 1101 1000 1011 1101 0000 1000 1000 1111 0110 0011 0010 1100 1000 1111 0100 0100 0011 1010 0011 0010 0010 0010 0011 0000 1000 0000 1100 0100 0000 0010 0011 
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0001 0000 1110 1111 0110 0011 0010 1100 0000 1000 1111 1101 0011 1100 1000 1000 1000 1010 0011 0110 0010 0011 0010 0001 1111 0100 0000 1111 0100 1010 1010 0000 1110 
0000 0110 0011 0001 0000 1101 0011 1011 1111 0111 1000 1011 0010 0011 1101 0010 0100 1000 0011 1000 1000 1000 1100 0100 0000 0111 1101 0000 0100 1101 0000 1100 1000 
1111 0100 0100 1000 0111 1101 1000 1100 1011 0010 0011 1101 1000 0100 1000 1000 1111 1101 0011 0100 1010 1111 0110 0010 1010 0000 0111 0010 0010 0001 1111 0110 1000 
1000 0100 1000 0000 1111 1101 0000 1010 0100 1111 0100 0111 0001 0010 1010 0001 0000 1110 0010 0111 1101 0000 0100 1000 0001 1100 0111 1000 0111 1101 1000 1100 1101 
1111 0110 0011 1000 1000 0000 0011 1010 0001 0001 1100 0000 1000 1100 1000 1111 0100 0100 0011 1000 1010 0011 0110 0010 0011 0000 0000 1000 1100 0100 0011 0100 1110 
1111 0100 1000 0011 1000 0001 0011 0100 0011 0010 0000 0011 1111 0110 1001 0001 0010 0011 0010 1100 0100 0011 1011 1101 0010 0100 1000 0011 1000 1000 1000 1100 0100 
0000 0111 1101 0011 0000 0000 1000 1100 1000 1000 1000 0100 0000 0000 0111 1111 0100 0100 0011 1010 0011 0011 0111 1101 0011 1110 0010 0011 0110 0011 0010 0000 0100 
0011 1010 0001 1111 1111 1101 0111 1010 0010 0000 0000 1110 1000 0100 0111 0000 0010 0011 0001 0000 1101 0011 1011 1101 0001 0010 0001 1111 0100 0000 0000 0100 0001 
0011 0100 1100 0011 1100 0111 0001 0010 0001 0010 1100 1000 0000 1111 1101 0000 1010 0100 1111 0110 0011 0010 1100 1000 1111 0110 0010 0001 0000 0010 0011 0110 0001 
0011 0100 1100 0010 0011 1101 1010 0100 1011 0001 0000 0001 0010 1111 1101 0001 1100 0100 0011 1000 0101 1000 0111 1101 0000 0000 1100 0001 0000 1110 0011 0111 1101 
0000 0000 0001 0001 0000 0011 1000 0111 1101 0001 0000 1110 1111 0100 0000 0011 1011 1101 0011 0110 0010 0000 1100 1000 1000 1011 1101 1000 0100 1111 0010 0000 0001 
0001 0000 1010 0001 0000 1000 0000 1111 1101 0000 1010 0100 1111 0100 1100 0010 0010 0001 1000 0100 1000 0011 1000 1001 0010 0010 0010 1111 0101 0111 0110 1110 0101 
1111 0110 1000 1000 0100 0100 0011 1000 1001 1111 0110 0011 1000 1000 0000 0011 1010 0001 0010 1000 1000 1000 1011 1101 0101 1101 1011 1001 0111 1101 0011 0000 1101 
0001 1100 1000 0000 0110 1000 0001 1100 1000 1000 0111 1101 1000 1100 1101 1111 0100 0001 0000 0010 0010 1000 1010 0100 1111 0100 0000 0011 0000 0100 0011 1000 1101 
1111 0100 0000 0000 0100 0100 0000 1110 0001 1111 0100 0000 0011 1000 0011 1111 0110 0011 0011 0111 1101 1000 1000 1000 0000 0000 0011 1111 0110 0011 0010 1100 1000 
1111 0100 1100 0101 1101 1011 1001 0111 1101 1000 1100 1011 1000 1000 1000 0010 0011 1101 0011 1010 1000 0000 0100 0111 0010 0000 1101 1000 1100 0100 0000 1100 1000 
1000 0111 1101 0000 0010 0011 1111 0100 0000 1111 0110 0011 0001 0000 1100 0010 0011 1111 1111 0101 1110 0010 1100 1000 1111 0100 1001 0010 0000 1110 0010 0010 0011 
0001 0000 0001 1111 0100 0001 0011 0100 0011 0010 0011 1101 0001 0010 0001 1111 0100 1011 0001 0000 1001 0010 1100 0111 1001 0011 1101 1000 0100 0100 0011 0000 0100 
0001 1100 0000 1000 1011 1101 0000 0000 1100 0011 0100 1110 0010 0111 1101 0000 0000 0111 0001 1111 1101 0011 0110 0010 0010 0100 0000 0011 1000 0100 1000 0100 1100 
1000 0111 1101 0000 0000 1110 0000 1111 1101 0000 0100 0000 0011 1011 1101 0000 1000 1000 1111 0100 1000 1010 1100 1111 1000 1000 1000 1000 0110 0001 0010 0000 0011 
1111 0100 0100 0011 1011 1101 0000 0011 1101 1000 0100 0100 0011 0000 1111 0001 1100 1000 1111 0110 0011 0000 0000 0010 0001 1100 1000 1111 0110 1001 0001 0010 0011 
0010 1111 1101 1101 1011 1011 1111 0100 1000 0011 1010 0011 1000 1000 0100 0010 0010 0001 1111 1110 0101 1011 0001 0000 0111 1011 1101 0001 0010 0001 1111 0100 0000 
0011 1011 1101 0000 0000 0001 1000 1000 1101 0011 1010 0100 0011 0011 1101 0010 1000 1101 1000 1011 1101 1000 1100 1011 0010 0011 1101 0010 1000 1101 1010 0010 0010 
1111 0110 0011 1001 0000 1111 0010 0010 0001 1111 0100 1101 0010 1011 1101 0000 1000 0000 1000 0100 1000 1000 0111 1101 0010 1000 1101 1010 0000 1110 0000 1111 1101 
0001 0000 1110 1111 0100 0000 1111 0110 1110 0110 1110 0101 1111 0100 1100 0011 0100 0111 0010 0000 0001 1010 0000 0111 0010 0011 1101 0000 0000 0011 0010 0000 1110 
0001 0000 1110 0010 0011 1101 0000 0110 0100 1000 1100 1101 1000 0100 0100 0011 1000 1000 1111 0100 1001 1010 0000 0000 0011 1000 0100 0011 1000 1000 1111 0100 0000 
0011 1000 0011 1111 0110 0011 0010 1110 0100 0011 0000 0100 0011 1000 1000 1111 1110 1100 0011 0100 1110 0010 0110 0010 0000 0010 0011 1010 0000 0111 0000 0010 0011 
0001 0000 1101 0011 1010 0001 1111 1111 1101 0100 1000 1000 1000 1000 1000 1111 0100 0100 1000 0111 1101 1001 0000 1101 1010 0010 0010 1111 0110 0010 0010 0010 1001 
0000 0010 0010 0000 1111 1111 1111 0100 1010 0001 1100 0000 0010 0111 1101 0000 1011 1000 1111 1000 0111 0011 0100 1001 1001 0011 1101 0000 0111 1011 0011 1011 1101 
0000 1011 1001 1111 0100 1010 1010 0000 1110 1111 0110 0011 1111 1011 1110 1111 0111 1111 1011 1000 1101 0011 1010 0011 1111 0100 1010 0011 0110 0010 0010 0100 1000 
1000 1111 1101 1000 1100 1101 1111 0100 1111 1010 0010 0011 1111 0110 1000 0011 1000 0011 0010 0010 0010 1000 0100 0001 0011 0110 0010 0010 0010 0001 1111 0100 0010 
0010 0010 0011 1010 0100 1000 0010 0000 1110 1111 0110 0011 0010 1100 1000 1111 0110 1001 0011 0110 0010 0000 1110 0001 1111 0100 0000 0011 1000 0011 1111 0110 1000 
1000 0100 1000 1111 0110 0011 0010 1100 1000 1111 0100 1010 0001 1100 0000 0010 0111 1101 0010 1000 1101 1000 1000 1100 0000 0010 0011 1111 0110 0011 0011 0111 1101 
1000 0110 1000 0011 0000 0010 0001 0010 0011 1111 11

STEP 1

As the chunks are not 7 or 8 bits, these do not seem to be ASCII. Also with the name of the challenge we can try to decode this as DNA Sequence (AGCT) bases.

This data is in binary, one block contains mapping of two DNA bases as the last block is 11.

The mappings are :

00 -> A
01 -> G
10 -> C
11 -> T

STEP 2

So I created a python script to convert this into above SEQUENCE via file input. the script will read from data file and will write the sequence to dna file.

## X64MAYHEM

raw=[]

with open("data","r") as file:
    s=file.readlines()
    raw=s

data=""
for i in raw:
    str=i
    str=str.strip('\n')
    # print(str)
    str=str.split(' ')
    str.pop()
    for i in str:
        r=i[0:2]
        l=i[2:]
        print(r+'-'+l)
        if(r == '00'):
            data+='A'
        elif(r == '10'):
            data+='C'
        elif(r == '01'):
            data+='G'
        elif(r == '11'):
            data+='T'
        if(l == '00'):
            data+='A'
        elif(l == '10'):
            data+='C'
        elif(l == '01'):
            data+='G'
        elif(l == '11'):
            data+='T'

data+='T'

print(data)

with open("dna","w")as file:
    file.write(data)

So we get the following in the dna file :

GAGATCTTGAACAGAATGAGTATGACGCGATTGAAATTGACGACAATCACATTGAGACAGTTGAAATTGCAGACACAACCAACAATCAAGACATTGATGACCTTGATCCCAAAGAGTACAATGCATAGAAATACACAGTTGAGAATCTTGCTCGCTCGGTTGATGCACTTGGGTGCTCGGTTGCATACTAAACATTTGACAATCAAGATGAATACACAGTTGCATACTACATTGCAGCGAATCCATACTACACAGAGACAGTTGATGACCTTGAAATTGACGACAATCACATTGATTCACATGAATCCAAAGCATTTGACAAGACATACTACACACTTGGGTGCTCGGTTGATGCACTTGATTCACATGCATACAAGAATCTTTTTGCTCCCACACAGAATCACGTTGACGACAATCACATTGACACCTATTCACACACAGCAGAGAATGATCTTGCATACTACATTGCTCGCTCGGTTGAGACAGTTGACCAGACACCAGCATTTGAAGATGATTAGAACAAATTTGAGAATCCATATGTTGGGTGCTCGGTTTTTGGTCACTACATTGGGTGCTCGGTTGAAGAAAATCTTGAACACATTGAATAGACACACAAAGCATAGTCGATTGACCCCAATCAAGCATAGAATGATCAAAAGTTTGATGCACTTGAACACATTGCATACTACATTGAGAATCCATACACACATAACAAATAGAAAACATACATTGCATACAATAATTAGTAAACATACATTGACCATGCACTTGAAATTGATTCACATGCATACAAGAATCTTGCATACTAAACATTTGATTACACACACCATGCACATACAGTTGAAATTGACCCCAATCAAGCATAGAATGATCTTTGTCACTACATTGACGACAATCACACATAGAAAGTTGAAGATGAATACATTGAGACAGTTGCATACTACATTGCAGACACATTTGATGACCTTGCACCCAAGTACACAGTTGCCACAGACAAATTTGAACCGATTGAGTAGACCCAGAATCACGTTGAAGACAAGTAGTCAGTTGCATATGTTGCATCACAAAATCCAGAGTAAACATACATTGAGAATCACCATGCACATAAAACATAGAATGATCTTGACAATCAAGATGAATACAAATTTGCCGAGACATACTAGAATCTTGACGACAATCACACATAGAAAGTTGATAAAACATACACACAGAAAAAGTTTGAGAATCCATATGTTGATTCACATGCATACAAGAATCCAGTTTTTGGTCCACAAAATCCAGAGTAAACATAGAATGATCTTGAGACAGTTGAAAAAGAAGATGATAATTAGTAGACAGACTACAAATTTGAACCGATTGCATACTACATTGCACAGAAACATGCAGATGATAACATTGCCGACTAGAAAGACTTTGAGTAGAATCAGGCAGTTGAAAATAAGAATCATGTTGAAAAAGAGAAATCAGTTGAGAATCTTGAAAATCTTGATGCACAATACACACTTGCAGATTACAAAGAGAACCAGAACAAATTTGAACCGATTGATAACACAGCAGACAATCACGACACACTTGGGTGCTCGGTTGCCACAGAGAATCACGTTGCATCACAAAATCCAGACCACACACTTGGGTGCTCGGTTGATAATGAGTACAAAGCCAAGTACACAGTTGCATATGTTGAAGAAACACCACCGATTGAAAATAAGAATCATGTTGAAAAAGAGAAATCAGTTGAAAATCAATTTGCATATGTTGCACACAAAAAATTTGCATACTACATTGATAGGTGCTCGGTTGCATACTCACACAACATTGATCCCAAAGAGTACAATGCATAGAAATACACAGTTGAAACATTTGAAATTGCATAGAATAACATTTTTGGTCACTACATTGACGACAATCACACATAGAAAGTTGAAGATGAATACATTGAGACAGTTGACTAGAACGACTAGTCGATTGCAGAGAATAAGAAGTAAACACTTGAAAATAATGATCACGTTGAAAAGTAGTTTGATGCACACGAAAATCAGACAGATACAGTTGAAAATCAATTTGAAGAAAATCTTGAACACATTGACACCTATTCACACACAGCAGACAAATTTGAGAATCTTGAAATTGCAGAGAATAATTAGTACATTGCATAAAAACAGTACATTGCCGAGACATACTTTGTGCTCTTTGACAATCCATCACAGAACACAGTTTCGGCTAGAAGTCTTGAGACAGTTGAAAATCTTGAAAAAGCACATGATCCGAATATTGACCATGCACTTGCATACTACATTGACCATGCCACACTTGCATCGAATTACACAGTTGATGACCTTGAACAAACAGACACAGTTGACCATGCCAATCAATTTGAGAATCTTGAAATTGCTCGCTCGGTTGATAATGAGTACAAAGCCAAGTACATTGAAAAATACAATCAGAATCACATTGAAGCGACATATGCAGAGAATCACATTGACGCCAAAAATCAGAATCACATTGAAAATCAATTTGCATACTCGAATAAGAATCACATTTCTAATGATCACGCACAAACATCCAAGTAAACATAGAATGATCCAGTTTTTGGACACACACACATTGAGACAGTTGCGAATGCCACACTTGCACACACCGAAACACAATTTTTTGACCAGTAAAACGTTGAACTCATTCAGTATGACGCGATTGAAGTCTATCTTGAACTCGTTGACCCCAATCTTGCATTTCTTCTTGTTTCTCATGATCCATTTGACCATGCACACGACACATTTGCATATGTTGATTCCACATTTGCCAATCAATACACACCAGAAGATGCACACACAGTTGAACACACATCCGACAACAATCTTGCATACTACATTGCCGATGCACAATCAGTTGAAAATCAATTTGCCACAGACATTGCATACTACATTGACCAGTAAAACGTTGACCATGCACATAAAACATTTGCATATGTTGCAGCCAATAAACAGACATTTT

STEP 3

Now we need to convert this into ascii, I found a python mapping online and made a script to read from our dna file and print the ASCII mapping.

mapping = {
        
'AAA':'a',
'AAC':'b',
'AAG':'c',
'AAT':'d',
'ACA':'e',
'ACC':'f', 
'ACG':'g',
'ACT':'h',
'AGA':'i',
'AGC':'j',
'AGG':'k',
'AGT':'l',
'ATA':'m',
'ATC':'n',
'ATG':'o',
'ATT':'p',
'CAA':'q',
'CAC':'r',
'CAG':'s',
'CAT':'t',
'CCA':'u',
'CCC':'v',
'CCG':'w',
'CCT':'x',
'CGA':'y',
'CGC':'z',
'CGG':'A',
'CGT':'B',
'CTA':'C',
'CTC':'D',
'CTG':'E',
'CTT':'F',
'GAA':'G',
'GAC':'H',
'GAG':'I',
'GAT':'J',
'GCA':'K',
'GCC':'L',
'GCG':'M',
'GCT':'N',
'GGA':'O',
'GGC':'P',
'GGG':'Q',
'GGT':'R',
'GTA':'S',
'GTC':'T',
'GTG':'U',
'GTT':'V',
'TAA':'W',
'TAC':'X',
'TAG':'Y',
'TAT':'Z',
'TCA':'1',
'TCC':'2',
'TCG':'3',
'TCT':'4',
'TGA':'5',
'TGC':'6',
'TGG':'7',
'TGT':'8',
'TTA':'9',
'TTC':'0',
'TTG':' ',
'TTT':'.'

	
	
}

string=""

with open("dna","r") as f:
	string=f.readline()

def decode_dna( string ):

    pieces = []
    for i in range( 0, len(string), 3 ):
        piece =  string[i:i+3]
        ## X64MAYHEM
        pieces.append( mapping[piece] )

    return "".join(pieces)

  
print (decode_dna(string))

This gave us the following :

In biology a gene is a sequence of nucleotides in DNA or RNA that encodes the synthesis of a gene product either RNA or protein. During gene expression the DNA is first copied into RNA. The RNA can be directly functional or be the intermediate template for a protein that performs a function.The genetic code is the set of rules used by living cells to translate information encoded within genetic material into proteins. Translation is accomplished by the ribosome which links amino acids in an order specified by messenger RNA using transfer RNA molecules to carry amino acids and to read the mRNA three nucleotides at a time. The genetic code is highly similar among all organisms and can be expressed in a simple table with 64 entries.ACGT is an acronym for the four types of bases found in a DNA molecule adenine cytosine guanine and thymine.Congratulations. Here is your reward. flag b10logy c4n b3 fun t00 .Dont forget to put underscores between the words and use the flag format to sumbit.

FLAG

pCTF{b10logy_c4n_b3_fun_t00}

NOTE

ALL THE CODE AND DATA IS UNDER _docs FOLDER